13 lines
917 B
R
13 lines
917 B
R
abAbbrevs = c('AMB', 'AMC', 'AMK', 'AMP', 'AMX', 'ANI', 'ATM', 'AZA', 'CAS', 'CAZ', 'CCV',
|
|
'CHL', 'CIP', 'CIX', 'CLF', 'CLI', 'COL', 'CPC', 'CRO', 'CTC', 'CTX', 'CXM',
|
|
'CZA', 'CZO', 'CZT', 'DAP', 'DOX', 'ERY', 'FCT', 'FEP', 'FLC', 'FLU',
|
|
'FOS', 'FOX', 'FOX1', 'FUS', 'GEN', 'GRI', 'IPM', 'ITR', 'KAN', 'LNZ',
|
|
'LVX', 'MCZ', 'MEM', 'MFX', 'MIF', 'MNO', 'MTR', 'MUP', 'NAL', 'NIT',
|
|
'NOR', 'PEN', 'PIP', 'PLB', 'POS', 'QDA', 'RIF', 'SAM', 'STR1',
|
|
'SXT', 'TEC', 'TEM', 'TGC', 'TMP', 'TOB', 'TRB', 'TZP', 'VAN', 'VOR')
|
|
|
|
patchFirstColumns = c('sampleid', 'date', 'is_clinical', 'is_icu', 'is_outward',
|
|
'IsolNr', 'Materiaal', 'specimen_type', 'specimen_group',
|
|
'patientid', 'birth_date', 'department', 'type_dept',
|
|
'specialism', 'age', 'gender', 'MIC', 'RAP', 'mo')
|