1
0
mirror of https://github.com/msberends/AMR.git synced 2025-07-10 07:41:57 +02:00

fix AMR vignette

This commit is contained in:
2022-08-28 22:38:08 +02:00
parent e975a3043c
commit e7af5fc716
9 changed files with 20 additions and 17 deletions

View File

@ -29,7 +29,7 @@
library(dplyr, warn.conflicts = FALSE)
devtools::load_all(quiet = TRUE)
suppressMessages(set_AMR_locale("en"))
suppressMessages(set_AMR_locale("English"))
old_globalenv <- ls(envir = globalenv())
@ -473,7 +473,7 @@ rm(list = current_globalenv[!current_globalenv %in% old_globalenv])
rm(current_globalenv)
devtools::load_all(quiet = TRUE)
suppressMessages(set_AMR_locale("English"))
# Update URLs -------------------------------------------------------------
usethis::ui_info("Checking URLs for redirects")
@ -500,3 +500,4 @@ invisible(capture.output(styler::style_dir(
# Finished ----------------------------------------------------------------
usethis::ui_done("All done")
suppressMessages(reset_AMR_locale())

View File

@ -1,6 +1,6 @@
pattern regular_expr case_sensitive affect_ab_name affect_mo_name zh da nl fr de el it ja pl pt ru es sv tr uk
language name English FALSE FALSE FALSE FALSE Chinese Danish Dutch French German Greek Italian Japanese Polish Portuguese Russian Spanish Swedish Turkish Ukrainian
language name FALSE FALSE FALSE FALSE 汉语 Dansk Nederlands Français Deutsch Ελληνικά Italiano 日本語 Polski Português Русский Español Svenska Türkçe украї́нська
language name FALSE FALSE FALSE FALSE 汉语 Dansk Nederlands Français Deutsch Ελληνικά Italiano 日本語 Polski Português Русский Español Svenska Türkçe Українська
Coagulase-negative Staphylococcus TRUE TRUE FALSE TRUE 凝固酶阴性葡萄球菌 Koagulase-negative stafylokokker Coagulase-negatieve Staphylococcus Staphylococcus à coagulase négative Koagulase-negative Staphylococcus Σταφυλόκοκκος με αρνητική πηκτικότητα Staphylococcus negativo coagulasi コアグラーゼ陰性ブドウ球菌 Staphylococcus koagulazoujemny Staphylococcus coagulase negativo Коагулазоотрицательный стафилококк Staphylococcus coagulasa negativo Koagulasnegativa stafylokocker Koagülaz-negatif Stafilokok Коагулазонегативний стафілокок
Coagulase-positive Staphylococcus TRUE TRUE FALSE TRUE 凝固酶阳性葡萄球菌 Koagulase-positive stafylokokker Coagulase-positieve Staphylococcus Staphylococcus à coagulase positif Koagulase-positive Staphylococcus Σταφυλόκοκκος θετικός στην πήξη Staphylococcus positivo coagulasi コアグラーゼ陽性ブドウ球菌 Staphylococcus koagulazo-dodatni Staphylococcus coagulase positivo Коагулазоположительный стафилококк Staphylococcus coagulasa positivo Koagulaspositiva stafylokocker Koagülaz-pozitif Stafilokok Коагулазопозитивний стафілокок
Beta-haemolytic Streptococcus TRUE TRUE FALSE TRUE β-溶血性链球菌 Beta-haemolytiske streptokokker Beta-hemolytische Streptococcus Streptococcus Bêta-hémolytique Beta-hämolytischer Streptococcus Β-αιμολυτικός στρεπτόκοκκος Streptococcus Beta-emolitico ベータ溶血性レンサ球菌 Streptococcus beta-hemolityczny Streptococcus Beta-hemolítico Бета-гемолитический стрептококк Streptococcus Beta-hemolítico Beta-hemolytiska streptokocker Beta-hemolitik Streptokok Бета-гемолітичний стрептокок
@ -269,4 +269,4 @@ Glycopeptides FALSE TRUE TRUE FALSE 糖肽类药物 Glykopeptider Glycopeptiden
Macrolides/lincosamides FALSE TRUE TRUE FALSE 大环内酯类/林可酰胺类 Makrolider/lincosamider Macroliden/lincosamiden Macrolides/lincosamides Makrolide/Linkosamide Μακρολίδια/λινκοσαμίδια Macrolidi/lincosamidi ポリミキシン Makrolidy/linkozamidy Macrolides/lincosamidas Макролиды/линкозамиды Macrólidos/lincosamidas Makrolider/linkosamider Makrolidler/linkozamidler Макроліди/лінкозаміди
Other antibacterials FALSE TRUE TRUE FALSE 其他抗菌剂 Andre antibakterielle stoffer Overige antibiotica Autres antibactériens Andere Antibiotika Άλλα αντιβακτηριακά Altri antibatterici キノロン Inne środki przeciwbakteryjne Outros antibacterianos Другие антибактериальные препараты Otros antibacterianos Andra antibakteriella medel Diğer antibakteriyeller Інші антибактеріальні засоби
Polymyxins FALSE TRUE TRUE FALSE 多粘菌素类 Polymyxiner Polymyxines Polymyxines Polymyxine Πολυμυξίνες Polimixine ポリミキシン Polimyksyny Polimixinas Полимиксины Polimixinas Polymyxiner Polimiksinler Поліміксини
Quinolones FALSE TRUE TRUE FALSE 喹诺酮类 Kinoloner Quinolonen Quinolones Quinolone Κινολόνες Chinoloni キノロン Quinolony Quinolones Хинолоны Quinolonas Kinoloner Kinolonlar Хінолони
Quinolones FALSE TRUE TRUE FALSE 喹诺酮类 Kinoloner Quinolonen Quinolones Quinolone Κινολόνες Chinoloni キノロン Quinolony Quinolones Хинолоны Quinolonas Kinoloner Kinolonlar Хінолони

1 pattern regular_expr case_sensitive affect_ab_name affect_mo_name zh da nl fr de el it ja pl pt ru es sv tr uk
2 language name English FALSE FALSE FALSE FALSE Chinese Danish Dutch French German Greek Italian Japanese Polish Portuguese Russian Spanish Swedish Turkish Ukrainian
3 language name FALSE FALSE FALSE FALSE 汉语 Dansk Nederlands Français Deutsch Ελληνικά Italiano 日本語 Polski Português Русский Español Svenska Türkçe украї́нська Українська
4 Coagulase-negative Staphylococcus TRUE TRUE FALSE TRUE 凝固酶阴性葡萄球菌 Koagulase-negative stafylokokker Coagulase-negatieve Staphylococcus Staphylococcus à coagulase négative Koagulase-negative Staphylococcus Σταφυλόκοκκος με αρνητική πηκτικότητα Staphylococcus negativo coagulasi コアグラーゼ陰性ブドウ球菌 Staphylococcus koagulazoujemny Staphylococcus coagulase negativo Коагулазоотрицательный стафилококк Staphylococcus coagulasa negativo Koagulasnegativa stafylokocker Koagülaz-negatif Stafilokok Коагулазонегативний стафілокок
5 Coagulase-positive Staphylococcus TRUE TRUE FALSE TRUE 凝固酶阳性葡萄球菌 Koagulase-positive stafylokokker Coagulase-positieve Staphylococcus Staphylococcus à coagulase positif Koagulase-positive Staphylococcus Σταφυλόκοκκος θετικός στην πήξη Staphylococcus positivo coagulasi コアグラーゼ陽性ブドウ球菌 Staphylococcus koagulazo-dodatni Staphylococcus coagulase positivo Коагулазоположительный стафилококк Staphylococcus coagulasa positivo Koagulaspositiva stafylokocker Koagülaz-pozitif Stafilokok Коагулазопозитивний стафілокок
6 Beta-haemolytic Streptococcus TRUE TRUE FALSE TRUE β-溶血性链球菌 Beta-haemolytiske streptokokker Beta-hemolytische Streptococcus Streptococcus Bêta-hémolytique Beta-hämolytischer Streptococcus Β-αιμολυτικός στρεπτόκοκκος Streptococcus Beta-emolitico ベータ溶血性レンサ球菌 Streptococcus beta-hemolityczny Streptococcus Beta-hemolítico Бета-гемолитический стрептококк Streptococcus Beta-hemolítico Beta-hemolytiska streptokocker Beta-hemolitik Streptokok Бета-гемолітичний стрептокок
269 Macrolides/lincosamides FALSE TRUE TRUE FALSE 大环内酯类/林可酰胺类 Makrolider/lincosamider Macroliden/lincosamiden Macrolides/lincosamides Makrolide/Linkosamide Μακρολίδια/λινκοσαμίδια Macrolidi/lincosamidi ポリミキシン Makrolidy/linkozamidy Macrolides/lincosamidas Макролиды/линкозамиды Macrólidos/lincosamidas Makrolider/linkosamider Makrolidler/linkozamidler Макроліди/лінкозаміди
270 Other antibacterials FALSE TRUE TRUE FALSE 其他抗菌剂 Andre antibakterielle stoffer Overige antibiotica Autres antibactériens Andere Antibiotika Άλλα αντιβακτηριακά Altri antibatterici キノロン Inne środki przeciwbakteryjne Outros antibacterianos Другие антибактериальные препараты Otros antibacterianos Andra antibakteriella medel Diğer antibakteriyeller Інші антибактеріальні засоби
271 Polymyxins FALSE TRUE TRUE FALSE 多粘菌素类 Polymyxiner Polymyxines Polymyxines Polymyxine Πολυμυξίνες Polimixine ポリミキシン Polimyksyny Polimixinas Полимиксины Polimixinas Polymyxiner Polimiksinler Поліміксини
272 Quinolones FALSE TRUE TRUE FALSE 喹诺酮类 Kinoloner Quinolonen Quinolones Quinolone Κινολόνες Chinoloni キノロン Quinolony Quinolones Хинолоны Quinolonas Kinoloner Kinolonlar Хінолони