134 lines
3.2 KiB
Plaintext
134 lines
3.2 KiB
Plaintext
|
name,pathogen_group
|
||
|
Coagulase-negative Staphylococcus (CoNS),2
|
||
|
Escherichia coli,1
|
||
|
Staphylococcus aureus,1
|
||
|
Enterococcus faecium,1
|
||
|
Klebsiella pneumoniae,1
|
||
|
Enterococcus faecalis,1
|
||
|
Pseudomonas aeruginosa,1
|
||
|
Streptococcus pneumoniae,1
|
||
|
Streptococcus mitis,1
|
||
|
Enterobacter cloacae,1
|
||
|
Micrococcus luteus,2
|
||
|
Milleri Group Streptococcus (MGS),1
|
||
|
Klebsiella oxytoca,1
|
||
|
Bacteroides fragilis,1
|
||
|
Serratia marcescens,1
|
||
|
Klebsiella variicola,1
|
||
|
Streptococcus agalactiae,1
|
||
|
Streptococcus dysgalactiae,1
|
||
|
Proteus mirabilis,1
|
||
|
Candida glabrata,1
|
||
|
Cutibacterium acnes,2
|
||
|
Candida albicans,1
|
||
|
Streptococcus salivarius,2
|
||
|
Bacillus,3
|
||
|
Haemophilus influenzae,1
|
||
|
Streptococcus parasanguinis,1
|
||
|
Aerococcus urinae,1
|
||
|
Enterococcus casseliflavus,1
|
||
|
Streptococcus pyogenes,1
|
||
|
Citrobacter freundii,1
|
||
|
Listeria monocytogenes,1
|
||
|
Parvimonas micra,1
|
||
|
Rothia mucilaginosa,2
|
||
|
Bacillus cereus,3
|
||
|
Bacteroides thetaiotaomicron,1
|
||
|
Corynebacterium jeikeium,3
|
||
|
Citrobacter koseri,1
|
||
|
Gemella morbillorum,1
|
||
|
(unknown Gram-positives),3
|
||
|
Salmonella,1
|
||
|
Salmonella enterica,1
|
||
|
Veillonella,1
|
||
|
Fusobacterium nucleatum,1
|
||
|
Hafnia alvei,1
|
||
|
Rothia dentocariosa,2
|
||
|
Schaalia odontolytica,2
|
||
|
Stenotrophomonas maltophilia,1
|
||
|
Streptococcus lutetiensis,1
|
||
|
Acinetobacter,1
|
||
|
Acinetobacter lwoffii,1
|
||
|
Aeromonas,1
|
||
|
Alistipes onderdonkii,1
|
||
|
Actinomyces oris,1
|
||
|
Anaerococcus octavius,1
|
||
|
Bacillus licheniformis,3
|
||
|
Bacteroides ovatus,1
|
||
|
Bacteroides vulgatus,1
|
||
|
Brevibacterium,3
|
||
|
Corynebacterium,3
|
||
|
Eggerthella lenta,1
|
||
|
Enterococcus avium,1
|
||
|
Granulicatella adiacens,1
|
||
|
Klebsiella aerogenes,1
|
||
|
Lactobacillus gasseri,1
|
||
|
Lactobacillus rhamnosus,1
|
||
|
Morganella morganii,1
|
||
|
Abiotrophia defectiva,1
|
||
|
Achromatium,3
|
||
|
Actinobaculum,2
|
||
|
Aeromonas hydrophila,1
|
||
|
Alloscardovia omnicolens,2
|
||
|
Aliivibrio finisterrensis,2
|
||
|
Actinomyces dentalis,2
|
||
|
Anaerococcus,1
|
||
|
Anaerococcus vaginalis,1
|
||
|
Bacillus pumilus,3
|
||
|
Bacteroides uniformis,1
|
||
|
Bifidobacterium longum,2
|
||
|
Butyrivibrio,2
|
||
|
Cellulosimicrobium cellulans,2
|
||
|
Campylobacter ureolyticus,1
|
||
|
Capnocytophaga sputigena,1
|
||
|
Corynebacterium afermentans,3
|
||
|
Corynebacterium amycolatum,3
|
||
|
Corynebacterium aurimucosum,3
|
||
|
Corynebacterium mucifaciens,3
|
||
|
Corynebacterium minutissimum,3
|
||
|
Corynebacterium tuberculostearicum,3
|
||
|
Corynebacterium urealyticum,3
|
||
|
Cutibacterium avidum,2
|
||
|
Eubacterium limosum,3
|
||
|
Eikenella corrodens,1
|
||
|
Enterobacillus,2
|
||
|
(unknown Gram-negatives),2
|
||
|
Helcococcus kunzii,1
|
||
|
Kocuria,1
|
||
|
Kocuria rhizophila,1
|
||
|
Lachnoanaerobaculum orale,3
|
||
|
Lactobacillus fermentum,2
|
||
|
Lactobacillus plantarum,2
|
||
|
Lactobacillus paracasei,2
|
||
|
Lancefieldella parvula,2
|
||
|
Micrococcus,2
|
||
|
Moraxella atlantae,1
|
||
|
Moraxella catarrhalis,1
|
||
|
Moraxella osloensis,1
|
||
|
Neisseria,2
|
||
|
Neisseria subflava,2
|
||
|
Odoribacter splanchnicus,1
|
||
|
Pantoea agglomerans,2
|
||
|
Pediococcus pentosaceus,1
|
||
|
Paenibacillus,1
|
||
|
Paenibacillus illinoisensis,1
|
||
|
Parabacteroides distasonis,1
|
||
|
Providencia rettgeri,1
|
||
|
Prevotella melaninogenica,1
|
||
|
Pseudomonas putida,1
|
||
|
Rhodococcus hoagii,1
|
||
|
Schaalia meyeri,1
|
||
|
Schaalia turicensis,1
|
||
|
Solobacterium moorei,2
|
||
|
Staphylococcus,2
|
||
|
Streptococcus equinus,1
|
||
|
Streptococcus gallolyticus,1
|
||
|
Streptococcus salivarius thermophilus,2
|
||
|
Veillonella atypica,1
|
||
|
Weissella,1
|
||
|
Candida dubliniensis,1
|
||
|
Candida nivariensis,1
|
||
|
Candida parapsilosis,1
|
||
|
Issatchenkia orientalis,1
|
||
|
Kluyveromyces marxianus,2
|
||
|
Meyerozyma guilliermondii,1
|