radar2/grouping microorganisms.csv

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2021-11-01 14:38:23 +01:00
name,pathogen_group
Coagulase-negative Staphylococcus (CoNS),2
Escherichia coli,1
Staphylococcus aureus,1
Enterococcus faecium,1
Klebsiella pneumoniae,1
Enterococcus faecalis,1
Pseudomonas aeruginosa,1
Streptococcus pneumoniae,1
Streptococcus mitis,1
Enterobacter cloacae,1
Micrococcus luteus,2
Milleri Group Streptococcus (MGS),1
Klebsiella oxytoca,1
Bacteroides fragilis,1
Serratia marcescens,1
Klebsiella variicola,1
Streptococcus agalactiae,1
Streptococcus dysgalactiae,1
Proteus mirabilis,1
Candida glabrata,1
Cutibacterium acnes,2
Candida albicans,1
Streptococcus salivarius,2
Bacillus,3
Haemophilus influenzae,1
Streptococcus parasanguinis,1
Aerococcus urinae,1
Enterococcus casseliflavus,1
Streptococcus pyogenes,1
Citrobacter freundii,1
Listeria monocytogenes,1
Parvimonas micra,1
Rothia mucilaginosa,2
Bacillus cereus,3
Bacteroides thetaiotaomicron,1
Corynebacterium jeikeium,3
Citrobacter koseri,1
Gemella morbillorum,1
(unknown Gram-positives),3
Salmonella,1
Salmonella enterica,1
Veillonella,1
Fusobacterium nucleatum,1
Hafnia alvei,1
Rothia dentocariosa,2
Schaalia odontolytica,2
Stenotrophomonas maltophilia,1
Streptococcus lutetiensis,1
Acinetobacter,1
Acinetobacter lwoffii,1
Aeromonas,1
Alistipes onderdonkii,1
Actinomyces oris,1
Anaerococcus octavius,1
Bacillus licheniformis,3
Bacteroides ovatus,1
Bacteroides vulgatus,1
Brevibacterium,3
Corynebacterium,3
Eggerthella lenta,1
Enterococcus avium,1
Granulicatella adiacens,1
Klebsiella aerogenes,1
Lactobacillus gasseri,1
Lactobacillus rhamnosus,1
Morganella morganii,1
Abiotrophia defectiva,1
Achromatium,3
Actinobaculum,2
Aeromonas hydrophila,1
Alloscardovia omnicolens,2
Aliivibrio finisterrensis,2
Actinomyces dentalis,2
Anaerococcus,1
Anaerococcus vaginalis,1
Bacillus pumilus,3
Bacteroides uniformis,1
Bifidobacterium longum,2
Butyrivibrio,2
Cellulosimicrobium cellulans,2
Campylobacter ureolyticus,1
Capnocytophaga sputigena,1
Corynebacterium afermentans,3
Corynebacterium amycolatum,3
Corynebacterium aurimucosum,3
Corynebacterium mucifaciens,3
Corynebacterium minutissimum,3
Corynebacterium tuberculostearicum,3
Corynebacterium urealyticum,3
Cutibacterium avidum,2
Eubacterium limosum,3
Eikenella corrodens,1
Enterobacillus,2
(unknown Gram-negatives),2
Helcococcus kunzii,1
Kocuria,1
Kocuria rhizophila,1
Lachnoanaerobaculum orale,3
Lactobacillus fermentum,2
Lactobacillus plantarum,2
Lactobacillus paracasei,2
Lancefieldella parvula,2
Micrococcus,2
Moraxella atlantae,1
Moraxella catarrhalis,1
Moraxella osloensis,1
Neisseria,2
Neisseria subflava,2
Odoribacter splanchnicus,1
Pantoea agglomerans,2
Pediococcus pentosaceus,1
Paenibacillus,1
Paenibacillus illinoisensis,1
Parabacteroides distasonis,1
Providencia rettgeri,1
Prevotella melaninogenica,1
Pseudomonas putida,1
Rhodococcus hoagii,1
Schaalia meyeri,1
Schaalia turicensis,1
Solobacterium moorei,2
Staphylococcus,2
Streptococcus equinus,1
Streptococcus gallolyticus,1
Streptococcus salivarius thermophilus,2
Veillonella atypica,1
Weissella,1
Candida dubliniensis,1
Candida nivariensis,1
Candida parapsilosis,1
Issatchenkia orientalis,1
Kluyveromyces marxianus,2
Meyerozyma guilliermondii,1